單中心MDS基因突變圖譜報道
2019.09.18

安諾優達攜手中國中醫科學院西苑醫院胡曉梅主任團隊,共同探索了骨髓增生異常綜合征(MDS)患者中的基因突變與臨床病理特征之間的關聯性,為MDS患者的臨床診療提供新思路的同時,豐富并補充中國MDS患者基因突變數據庫。該研究成果在線發表于腫瘤領域專業雜志Oncology Letters  


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研究背景

骨髓增生異常綜合征(MDS)是一組起源于造血幹/祖細胞的獲得性克隆性疾病,其特征是骨髓造血功能低下、長期進行性難治性血細胞減少和急性白血病轉化的高風險。随着測序技術的不斷發展,基因水平研究MDS的發病機制逐漸被報道。相關文獻顯示,70%-80%的MDS患者中至少含有1個體細胞基因突變,提示相關的基因異常與MDS的發病有關。基于二代測序(NGS)的基因突變檢測,有助于MDS患者的診斷分型、預後判定、指導治療、微小殘留病監測和克隆演變。

研究内容


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本研究采用安諾優達血液病127-gene panel對47例入組MDS初診患者骨髓/外周血樣本進行基因突變檢測,研究發現人群突變頻率為66.0%(31/47)。人群突變頻率≥5%的突變基因,分别為U2AF1(23.4%),SF3B1(12.8%),ASXL1(10.6%),TP53(8.5%),BCOR(8.5%),TET2(8.5%)和DNMT3A(6.8%)。


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基于突變基因功能組分類的統計結果,可以發現40.4%患者攜帶RNA剪切相關突變,23.4%患者攜帶DNA甲基化相關突變,23.4%患者攜帶染色質重塑相關突變,10.6%患者攜帶信号通路相關突變,8.5%患者攜帶腫瘤抑癌基因突變,6.4%患者攜帶轉錄因子相關突變,4.3%患者攜帶黏連蛋白複合體相關突變。部分基因之間存在共存現象,如EZH2-ASXL1NPM1-NRASRUNX1-PHF6等(P均<0.05)。


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從基因突變與臨床病理特征的分組分析結果,可以發現部分突變基因在臨床病理學分組中的分布情況存在統計學差異。基于突變基因與MDS分型的分析結果,可以發現JAK2突變頻率在MDS-U亞型中顯著高于非MDS-U亞型(P=0.04);基于突變基因與MDS細胞遺傳學風險的分析結果,可以發現SH2B3突變頻率在極高危風險組中顯著高于非極高危風險組(P=0.02),U2AF1突變頻率在中危風險組中傾向高于非中危風險組(P=0.07);基于突變基因與IPSS-R預後評分的分析結果,可以發現SETBP1EZH2突變頻率在IPSS-R預後高危組中均高于非IPSS-R預後高危組(P均=0.04)。

小結

本研究基于二代測序分析結果,發現47例MDS患者中有66.0%的患者被證實攜帶血液腫瘤相關基因突變,本研究中基因突變的結果将補充中國MDS患者的突變數據庫。當然,由于樣本量小,本研究中有關MDS患者的基因突變與臨床病理特征之間關聯結果,需要進一步更大隊列的分析結果來證實。


安諾優達血液病檢測

1、背景介紹

目前,臨床上對惡性血液病的診斷采用MICM分型。随着現代分子生物學技術的發展,尤其是基因序列檢測技術的逐步成熟,對血液病患者的檢查逐步深入到分子層面。血液病治療遵從預後分層的原則,即把患者分為高危、中危和低危三類,其中中危患者的治療異質性很大,屬于現有臨床分類方法中分類不明确的患者群體,急需更精确的預後分層方法。NCCN指南和WHO指南已率先引入基因突變對現有惡性血液腫瘤危險度預後分層系統做更細的分類。使用多基因聯合檢測的方法,通過體細胞突變對患者預後做出判斷,進而做出治療選擇。多基因聯合檢測的方法是對現有血液病預後分層體系的有益補充,在不遠的未來,随着對體細胞突變緻癌機理的深入理解,體細胞突變有望成為獨立的預後指标,為臨床醫生提供一個全新的血液病治療評價工具。 


2、檢測意義

1)急性髓細胞白血病預後分層;

2)骨髓增生異常綜合征預後分層;

3)骨髓增殖性腫瘤輔助診斷及預後評估;

4)靶向藥物相關及耐藥位點檢測;

5)複發難治患者病因探查;

6)疑似血液腫瘤但尚未明确疾病類型的疾病輔助診斷;

7)監控亞克隆低頻突變,預防複發或疾病亞型轉變;

8)化療獲益檢測。


3、檢測内容

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4、樣本要求

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5、适用人群

1)初診為各類型白血病的患者;

2)初診為骨髓增生異常綜合征(MDS)的患者;

3)初診為骨髓增殖性腫瘤(MPN)的患者;

4)初診為骨髓增生異常/骨髓增殖性腫瘤(MDS/MPN)的患者;

5)疑似血液腫瘤但尚未明确疾病類型的患者;

6)複發難治的患者。


6、檢測優勢

1)高覆蓋度,同時覆蓋多個目标基因及所有臨床熱點,實現一站式檢測;

2)高靈敏度,發現頻率低至5%的突變;

3)精确定量,可識别至1%的差異;

4)高分辨率,可檢測至單堿基變化;

5)高延展性,便于開展多位點、多基因的聯合分析;

6)專業的數據庫,實現本地化檢索;

7)可實現對FLT3-ITD、MLL-PTD等特殊變異類型的精準分析。

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